Açıklama: Covid-19'un Delta varyantı neden diğer suşlardan daha hızlı yayılıyor?

Covid-19'un Delta varyantı ile enfekte olan daha fazla insan, hasta olduklarından şüphelenmeden önce enfeksiyonu başkalarına bulaştırabilir.

Koronavirüse karşı önlem olarak yüz maskesi takan bir satıcı, 23 Ağustos 2021 Pazartesi, Kerala, Kochi'deki Fort Kochi plajında ​​satılık oyuncakları sergiliyor. (AP Fotoğrafı: RS Iyer)

Bilim adamları, virüsün bulaşmasının biyolojik temelini bulmak için zamanla yarışırken bulurlar. Delta varyantı Birkaç yeni çalışma, önemli mutasyonların aşıların azaltılmış etkinliği , ve hastalarda preemptomatik dönemde yüksek bulaşıcılık, hızlı yayılımı körükleyen ana nedenler arasındadır.

Yakın tarihli epidemiyolojik araştırmalar, Delta varyantının (B.1.617.2), 2020'nin sonlarında Birleşik Krallık'ta ilk kez tanımlanan Alfa varyantından en az yüzde 40 daha fazla bulaşıcı olduğunu göstermektedir. çoklu çalışma Delta varyantına karşı düşük aşı etkinliği gösteren, tam olarak aşılanmış kişiler de çığır açan enfeksiyonlar .

DSÖ başkanı Tedros Adhanom Ghebreyesus, bir basın toplantısında daha önce Delta'nın şimdiye kadar tanımlanan en bulaşıcı varyant olduğunu ve hızla gelişmekte olduğunu söylemişti. baskın Covid-19 türü bir çok ülkede. ABD Hastalık Kontrol ve Önleme Merkezlerinde (CDC) dolaşan dahili bir sunuma göre, Delta varyantı daha bulaşıcı MERS, SARS, Ebola, soğuk algınlığı, mevsimsel grip ve çiçek hastalığına neden olan virüslerden daha fazladır ve en az suçiçeği kadar bulaşıcıdır.

Kaynak: JHU CSSE ve covariants.org

Delta varyantı neden daha bulaşıcıdır?

Son araştırmalar, Delta varyantının şiddetli bulaşıcılığının arkasında önemli bir amino asit mutasyonunun olabileceğini düşündürmektedir.

Texas Üniversitesi Tıp Şubesi virologu Pei-Yong Shi liderliğindeki bir araştırma ekibi, SARS-CoV-2 spike proteinindeki tek bir amino asidi değiştiren önemli bir mutasyona odaklandı. Nature dergisinde yayınlanan çalışmayla ilgili bir rapora göre, değişiklik P681R olarak adlandırılıyor ve bir prolin kalıntısını bir arginine dönüştürüyor. Değişiklik, başak proteininin furin bölünme bölgesinde meydana gelir.

Hücrelere nüfuz etmek için SARS-CoV-2 spike proteininin konak proteinler tarafından iki kez kesilmesi gerekir. Covid-19'daki furin bölünme bölgesi önemlidir çünkü furin de dahil olmak üzere konakçı enzimlerin ilk kesimi yapabileceği anlamına gelir. Bundan sonra, enfekte olmuş bir hücreden yeni oluşan viral partiküller ortaya çıkar ve bu, konakçı hücreleri daha verimli bir şekilde enfekte edebilir.

Alfa varyantı, farklı bir amino asitte bir değişiklik içermesine rağmen, aynı yerde bir mutasyon da taşır. Çalışma, Delta durumunda, furin bölünmesini değiştiren mutasyonun derin bir etkisi olduğunu belirtiyor.

Yakın zamanda kullanıma sunulan çalışmanın bir ön baskısında, araştırmacılar, başak proteininin Delta varyant partiküllerinde Alfa'dan çok daha verimli bir şekilde kesildiğini ve sivri ucun verimli bir şekilde kırpılmasından büyük ölçüde P681R mutasyonunun sorumlu olduğunu belirttiler.

Çalışma, P681R mutasyonunun Delta varyantının yüksek bulaşıcılığının ve hızlı iletiminin anahtarını elinde tuttuğunu belirtiyor. Araştırmacılar, enfekte olmuş kültürlenmiş insan-hava yolu epitel hücrelerinde Delta varyantlarının Alfa'dan daha hızlı yayıldığını buldular. Ancak araştırmacılar P681R mutasyonunu kaldırdıklarında, iletim hızlarındaki fark kayboldu.

Çalışma, Tokyo Üniversitesi'nde bir virolog olan Kei Sato liderliğindeki bir ekip tarafından yürütülen ve P681R'yi taşıyan sivri proteinlerin, enfekte olmayan hücrelerin plazma zarlarıyla mutasyona göre neredeyse üç kat daha hızlı birleşebileceğini bulan araştırmanın bulgularını yansıtıyor. kayıp.

Kaynak: CoVariants.org ve GISAID aracılığıyla Our World in Data

Delta'nın hızlı iletiminden başka anahtar mutasyonlar da sorumlu mu?

Bilim adamları, Delta varyantının birkaç anahtar mutasyona sahip olduğunu ve P681R değişikliğinin önemli olmasına rağmen, hızlı iletimini körükleyen tek neden olma ihtimalinin düşük olduğunu söylediler.

Uganda'daki araştırmacılar, P681R değişikliğinin 2021'in başlarında ülkede geniş çapta yayılan ancak Delta kadar bulaşıcı olmadığı kanıtlanan bir varyantta bulunduğunu söyledi. bu Kappa varyantı , Delta'nın Hindistan'da tanımlanan kardeşi de aynı mutasyona sahipti, ancak araştırmacılar, spike proteininin daha az bölündüğünü ve hücre zarlarına daha az verimli bir şekilde kaynaştığını buldular.

Önceki çalışmalar, L452R ve D6146 gibi Delta varyantındaki diğer anahtar mutasyonların, virüsün reseptör hücrelere daha sıkı bağlanmasına ve bağışıklıktan daha kolay kaçmasına izin verdiğini bulmuştur.

Aslında, Delta varyantı, spike proteinin S1 alt biriminde, reseptör bağlama alanında üçü de dahil olmak üzere, ACE2 reseptörlerine bağlanma ve vücudun bağışıklık sisteminden kaçma yeteneğini geliştiren çoklu mutasyonlara sahiptir.

Virüsün hacim ve hız konusunda başarılı olduğunu düşünüyorum. Çok daha etkili bir virüs haline geldi. Cornell Üniversitesi'nden bir virolog olan Gary Whittaker, Nature'a verdiği demeçte, insanlardan ve hücrelerden çok daha hızlı geçiyor.

Whittaker ayrıca çalışmanın, koronavirüsün furin bölünme bölgesindeki mutasyonların öneminin altını çizdiğini söyledi. Ayrıca P681R'nin endişe yaratacak son furin bölünme bölgesi mutasyonu olmayacağını da ekledi.

Kaynak: CoVariants.org ve GISAID aracılığıyla Our World in Data

Delta varyantının yayılmasını durdurmak neden bu kadar zor?

Çin'in Guangzhou kentinde yapılan bir araştırma sırasında tespit edildiği üzere Delta varyantının hızla yayılmasının diğer nedenlerinden biri, hastalarda semptom öncesi aşamada bile son derece yüksek bulaşıcılık düzeyidir. Bu, insanların enfekte olabileceğinden şüphelenmeden önce bile virüsü yayma tehlikesi altında olduğu anlamına gelir.

Hong Kong Üniversitesi'nde epidemiyolog olan Benjamin Cowling ve meslektaşları tarafından yakın zamanda yapılan bir araştırma, insanların Delta ile enfeksiyondan 5.8 gün sonra - viral RNA için ilk pozitif testten 1.8 gün sonra - semptomlar göstermeye başladığını buldu. Bu nedenle, virüs bulaşmasının gerçekleşmesi için tehlikeli bir pencere bırakır.

Başka bir deyişle, semptomlar daha sonra ortaya çıktığından, Delta varyantı ile enfekte olan daha fazla insan, hasta olduklarından şüphelenmeden önce bile enfeksiyonu başkalarına bulaştırabilir.

Çalışma, Delta enfeksiyonlarının %74'ünün semptomatik öncesi evrede gerçekleştiğini buldu. Araştırmacılar ayrıca, Delta için enfekte olmuş tek bir kişinin bu hastalığı bulaştırması beklenebilecek ortalama insan sayısını temsil eden R-naught'un veya temel üreme sayısının 6.4 olduğunu buldular. Olayları bir perspektife oturtmak gerekirse, daha önce yapılan birkaç araştırmaya göre Wuhan soyunun R-naught'u 2 ila 4 arasındaydı.

Delta'ya karşı azaltılmış aşı etkinliği bir endişe konusu mu?

Birkaç çalışma, aşıların etkinliğinin Delta varyantına karşı azaldığını ve bunun da tam aşılı bireyleri yeni enfeksiyonlara karşı savunmasız bıraktığını bulmuştur.

Public Health England tarafından daha önce yapılan bir araştırma, Oxford-AstraZeneca aşısının etkinliğinin Delta varyantına karşı %64 . Daha önce, The Lancet dergisinde yayınlanan bir araştırma, Pfizer aşısı ile tam olarak aşılanmış olanların muhtemelen beş defadan fazla orijinal suşa kıyasla Delta varyantına karşı daha düşük nötralize edici antikor seviyeleri.

Daha yakın zamanlarda, İsrail Sağlık Bakanlığı'ndan alınan veriler, Pfizer'in iki atışının %64 koruma sunar Ülkede bildirilen vakaların yüzde 90'ından fazlasının Delta varyantından kaynaklandığı bir zamanda, Covid'e karşı.

Bir diğer endişe konusu ise aşıların etkinliğinin zamanla azalmasıdır. Birleşik Krallık'taki Oxford Üniversitesi'ndeki araştırmacılar ve ülkenin Ulusal İstatistik Ofisi'nin yakın tarihli bir araştırmasında, Pfizer aşısının etkinliğinin ikinci dozu aldıktan sonra ayda yüzde 90'a, iki ay sonra yüzde 85'e düştüğünü ve Üçten sonra yüzde 78. AstraZeneca için sunulan eşdeğer koruma yüzde 67, 65 ve yüzde 61 idi.

Çalışma ayrıca, tam olarak aşılanmış kişilerde bile, Delta varyantının neden olduğu enfeksiyonların, aşılanmamış bireylerdekine benzer en yüksek viral yükler ürettiğini buldu. ABD ve Singapur'da yapılan araştırmalar da benzer sonuçlar verdi.

Bu, en büyük endişe noktasının, tam aşılı kişilerin bile Delta varyantını yayabilmesi olduğu ve bu da bulaşma zincirini kırmayı çok zorlaştırdığı anlamına gelir.

CDC tarafından bu ay yayınlanan bir raporda, Massachusetts'in bir sahil kasabası olan Provincetown'daki büyük toplantıların ardından eyalette 469 Covid-19 vakası bildirildiği ve bunların yaklaşık dörtte üçünün aşılanmış kişilerden olduğu belirtiliyor.

Analizde, aşısız kişilerde olduğu gibi, aşı yaptıranlarda da yüksek ct değerleri , yüksek bir viral yüke işaret ediyor. 133 örneğin genom dizilemesinden sonra, vakaların %90'ının Delta varyantından kaynaklandığı bulundu. Bulguların ardından, CDC 27 Temmuz'da kılavuzlarını bir kez daha güncelledi ve tavsiye edilen ve hatta aşı olan kişilerin, Covid-19'un önemli ve yüksek bulaşının olduğu bölgelerde maske takmalarını önerdi.

Arkadaşlarınla ​​Paylaş: